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Rcpp和RcppArmadillo创建R语言包的实现方式

这篇文章主要为大家介绍了Rcpp和RcppArmadillo创建R包实现方式,有需要的朋友可以借鉴参考下,希望能够有所帮助,祝大家多多进步,早日升职加薪

目录
  • 1. 预先准备

    • 源文件示例func.cpp

    • 头文件示例test_h.h

  • 2. 创建R包步骤

    • 新建R Package

    • R包的文件结构

    • 修改DESCRIPTION文件

  • 3. C++11标准问题

    1. 预先准备

    Windows下需要安装Rtools,R中装好Rcpp和RcppArmadillo。创建C++源文件func.cpp,自定义头文件test_h.h

    源文件示例func.cpp

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    // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
    // [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
    #include <RcppArmadillo.h>
    #include <vector>
    #include "./test_h.h"
     
    using namespace Rcpp;
    using namespace std;
    // using namespace arma;
     
    // [[Rcpp::export]]
    RObject func(){
      arma::cube A(3,4,5,arma::fill::randu);
      std::cout<<CONDIT<<std::endl;
      return wrap(A);
    }

    // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]:用于指明需要使用RcppArmadillo。

    // [[Rcpp::plugins(cpp11)]]:指明需要使用C++11。

    #include "./test_h.h":表示使用第三方头文件。第三方头文件需要用双引号""包括起来,并加上.h./表示在当下文件夹(src)下搜寻文件。

    // using namespace arma;不一定有用。如果要用Armadillo的数据结构,在其之前需指明arma::

    func()函数将可以直接在R中调用。

    头文件示例test_h.h


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    #include <iostream>
    #define CONDIT 1000

    2. 创建R包步骤

    新建R Package

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    选择Package w/Rcpp, 并添加源文件。或者建立包以后,手动复制到src文件夹下。

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    R包的文件结构

    这里写图片描述

    修改DESCRIPTION文件

    将RcppArmadillo添加进Imports和LinkingTo中。

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    Package: RcppPackTest
    Type: Package
    Title: What the Package Does (Title Case)
    Version: 0.1.0
    Author: Who wrote it
    Maintainer: The package maintainer <yourself@somewhere.net>
    Description: More about what it does (maybe more than one line)
        Use four spaces when indenting paragraphs within the Description.
    License: What license is it under?
    Encoding: UTF-8
    LazyData: true
    Imports: Rcpp (>= 0.12.11), RcppArmadillo
    LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo

    Build & Reload 建立包

    3. C++11标准问题

    如果要使用C++11标准,第一种方法是在Makevars文件中添加如下代码:

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    CXX = g++-4.8.1
    PKG_CXXFLAGS = -std=c++11

    第二种方法是在.cpp文件前添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

    以上就是Rcpp和RcppArmadillo创建R包实现方式的详细内容

    原文链接:https://blog.csdn.net/iamsuperman2/article/details/77103568


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