nr数据库分库
我们下载的nr数据库非常大，2017年9月更新后所有nr的fasta文件已达72G,因而在进行nr比对时，如果不对nr库以类别进行区分，会非常耗我们的计算资源和时间，因而最好对下载的nr数据库进行分库，可以更准确快速的完成nr数据库比对。
nr数据库分库操作步骤：
首先明确我们需要分库的类别：细菌，真菌，真核生物，脊椎动物，植物
目前以脊椎动物为例，介绍如何进行nr数据库分库。
首先我们要得到脊椎动物的分类学ID，即NCBI数据库Taxonomy数据库的ID，如果我们不知道，可以通过已知脊椎动物的拉丁名在Taxonomy数据库中查找可得到以下界面
nr1.png
点击protein选项可得到如下界面
nr2.png
在linage中可看到红圈中的脊椎动物的分类，单击Vertebrata连接，可进入到脊椎动物的介绍页面，再单击Vertebrata可得到脊椎动物的分类学ID 7742
再次进入到Taxonomy页面，在搜索框中粘贴如7742这个ID。可得到以下的页面
nr3.png
单击右上角send to ，如图
nr4.png
点击creat file 将gi_list 存入到本地，基因ID较多需要花费较长时间。
得到GI list后，使用blast+的工具进行分库
blastdb_aliastool -gilist Vertebrata.gi -db /lustre/guest/bjjszx/nr/nr_database/nr -out Vertebrata_nr -title Vertebrata_nr
运行上述命令，即可得到两个文件
Vertebrata_nr.pal
Vertebrata_nr.p.gil
即可完成对于nr数据库的分库操作。
进行blast比对时，数据库填写成/path/to/Vertebrata_nr即可完成对于脊椎动物库的比对
作者：卡卡哈梅斯
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